Organizację i szczegółowe zadania Centrum określają:

• art. 33ze ustawy z dnia 29 listopada 2000 r. – Prawo atomowe (t. jedn. Dz. U. z 2024 r., poz. 1277)
• Zarządzenie Ministra Zdrowia z dnia 21 listopada 2019 r. w sprawie Krajowego Centrum Ochrony Radiologicznej w Ochronie Zdrowia (Dz. Urz. Min. Zdrow. poz. 97)